FAP Agri mematuhi semua peraturan perundang-undangan tentang pengelolaan lingkungan yang berlaku melalui ISPO (Indonesian Sustainable Palm Oil atau Perkebunan Kelapa Sawit Berkelanjutan Indonesia). Sertifikasi ISPO dikembangkan oleh Kementerian Pertanian ini dirancang untuk memberikan kepastian bagi konsumen bahwa perusahaan yang sudah memiliki sertifikasi ISPO telah mematuhi semua izin budidaya dan produksi minyak kelapa sawit, serta memenuhi seluruh kewajiban yang terkait dengan lisensi tersebut, diseluruh rantai nilai mulai dari pembebasan lahan hingga penjualan produk. 

FAP Agri telah mendapatkan sertifikat ISPO yang berlaku selama 5 tahun untuk ke tiga konsesi dan pabriknya yaitu PT. Karangjuang Hijau Lestari, PT. Bhumi Simanggaris Indah, PT. Tirta Madu Sawit Jaya.  

Sertifikasi halal adalah suatu sertikias yang dikeluarkan berdasarkan fatwa tertulis MUI (Majelis Ulama Indonesia) yang menyatakan kehalalan suatu produk sesuai dengan syariat Islam. Sertifikat halal ini merupakan syarat untuk mencantumkan label halal sehingga suatu produk layak untuk dikonsumsi oleh konsumen muslim. 

Seluruh produk komersil dari FAP Agri, seperti Tandan Buah Segar (TBS), Minyak Sawit Mentah (Crude Palm Oil), Palm Kernell Oil, Palm Kernel Expeller telah mendapatkan sertifikasi HALAL dari MUI Provinsi Kalimantan Timur.